Управління виконує такі функції:
1. аналіз фінансової та податкової звітності платників податків;
2. організація роботи з питань зупинення реєстрації податкових накладних/ розрахунків коригування в Єдиному реєстрі податкових накладних;
3. моніторинг фінансово-господарських операцій платників на наявність податкових ризиків;
4. надання консультацій з питань податкового законодавства, законодавства з питань сплати єдиного внеску та іншого законодавства;
5. забезпечення розгляду запитів і звернень народних депутатів України;
6. забезпечення виконання щодо забезпечення виконання прийнятих у встановленному законом порядку рішень про застосування спеціальних економічних та інших обмежувальних заходів (санкцій) до платників податків, у тому числі як невідкладних заходів із розв'язання кризових ситуацій, що загрожують національній безпеці України.