Сектор виконує такі основні функції:
1. здійснення контролю за пропускним режимом в ГУ ДПС;
2. забезпечення охорони державної таємниці в ГУ ДПС;
3. забезпечення технічного захисту інформації, контроль за його станом;
4. забезпечення заходів кіберзахисту інформації в інформаційно-комунікаційних системах в ГУ ДПС;
5. організація криптографічного захисту інформації з обмеженим доступом та контроль його стану.